Да запросто:
1) дать тиранидам сожрать Галактику. Поскольку Варп существует исключительно в Млечном пути, а тиранидская тень буквально разрушает Варп (Прибытие корабля-улья и его кораблей сопровождения предвещает следующий этап вторжения тиранидов в систему. Являясь мощным узлом разума улья, корабль-улей разрушает Варп в радиусе нескольких световых лет. К тому времени, когда одно из этих огромных существ, прибывает на планету, часто бывает слишком поздно посылать астропатический зов о помощи. Даже корабли, посланные защищать систему, находящуюся под угрозой нападения тиранидов, могут оказаться неспособными покинуть Имматериум в системе, попавшей под влияние тени в Варпе.), то, покрыв весь известный космос, Хаос и Варп будут уничтожены полностью;
2) активировать сеть пилонов. Тот же эффект, с дальнейшим превращением разумных существ в коматозных зомби. Сахарок безуспешно пытается построить такую сеть, поскольку его активно давят имперцы, хаоситы Вашторра и сами его бывшие союзники;
3) полная эвакуация в Паутину самых психически активных существ. Принцип сомнительный, поскольку души ТЭ пожираются Слаанешем без особых препятствий;
4) самому стать богом. Император за 10к лет поклонения достиг мощи, превосходящую всю Четверку, но пока до возрождения не сможет воспользоваться своими силами в полной мере; Слаанеша же добьет Иннеяд.
5) полное уничтожение человечества. Первая троица ТБ оголодает и ослабнет настолько, что они в лучшем случае упадут до уровня обычных грейтеров;
6) использовать оружие аналога ТЭТ, вроде уничтожения информации. Построил армию таких, выпустил в Варп, и Варп полностью оказывается съеден;
7) массовое внедрение гена Парии. Если подавляющее число населения Галактики станет париями, то они могут спокойно жить и без наличия Варпа, а Хаос в свою очередь сгинет.

Можете придумать еще варианты.