Просто повествование в основном ведётся от лица Империума, т.е. людей. И события происходят в населённой людьми галактике.
В книгах, повествующих о Крестовом Походе Императора и последующей Ереси Хоруса, упоминаются всякие ксенорасы, подверженные Хаосу, но они в основном зачищаются по ходу повествования(лишний повод восславить возлюбленного нами Императора за этот праведный ксеногеноцид).
Так что не сложно представить какую-нибудь далёкую галактику, где силы Хаоса дёргают за ниточки тамошние ксенорасы.
P.S. Среди многих космодесантников Хаоса всё ещё сильна ненависть к ксеносам. Порой в книгах можно встретить обвинения в сторону Императора, мол еслиб он не "предал" Крестовый Поход, все ксеносы галактики уже были бы уничтожены. Так что и главные любимчики тёмных "богов" не особо горят желанием сражаться бок о бок с ксеносами, даже если те служат тем же силам, что и они. Вот тебе и ещё одна причина.

Он походу просто задумался.

Чёрт. Вот я от жизни отстал.

Она покаялась в своих грехах и смиренно принимает кару.

Гвардия Смерти не распадалась? Занятно. Но применительно к нашей теме. Их вообще доспехи волнуют? :)
Пожиратели Миров? Скорей слетаются на резню по зову сильного лидера. Примарх ли их зовёт или Абаддон, какая разница? Остаются они при этом всё теми же варп бандами и снабжают себя сами, чем придётся.
Дети Императора? Но Фулгрим(который и не Фулгрим уже вовсе, если мне память не изменяет) же не занимается руководством легиона(он и раньше какие-то туманные цели подкидывал)? Те же варп банды, но при том смотрящие на всех и вся как на говно. Снабжают себя сами.
Железные Войны? Ну из того, что я читал выходит, что они разбились на некие образования, с мастерами осады(или как их там) во главе. Да, действительно, с производством у них всё зашибись и уж эти-то ребята точно могут позволить себе лучшую броню и оружие. Но они явно не представляют из себя легион.
Что касается Чёрного Легиона, учитывая какой Аббадон любимчик четвёрки ложны богов, то, что у них всё в порядке с организаций и то, что именно они являются заводилами Чёрных Крестовых Походов (предполагаю, что и долю добычи они имеют хорошую), можно смело утверждать, что и со снабжением у них всё в порядке, и одеты они куда лучше, чем какие-то там варп банды.

"есть где нибудь инфа" Есть инфа, что некоторым тёмным мехам доступны такие технологии, которые марсианам и не снились. К тому же поток еретиков тёк все эти тысячелетия.
Просто прикинем. Тут тебе и силы варпа, с возможностью усадить в предмет демона. И ксенотех. И всевозможные инновации, которые мягко говоря не приветствуются в Империуме. Я абсолютно убеждён, что еритехи способны производить продукцию в разы превосходящую имперские аналоги. Тут вопрос только в том, кто может её себе позволить? В то время как Ордена космодесанта тупо снабжаются.

Либо быть зажатым толпой мутантов/культистов, заблокирован опущенными переборками и выброшен в уям в космос, что тоже случается.

"и спереть его броню?"
А многие Ордена вообще на кораблях базируются. А значит склады, кузницы и реликварии они таскают с собой. А корабли имеют склонность порой теряться в варпе, либо же быть захваченными при внезапном абордаже, какой-нибудь хитропопой варп бандой. Вот вам и новенькие хаоситские броники.

Ну для начала интересно послушать, где автор созерцал "десятки тысяч легионеров" в новых доспехах. Всё-таки на момент 41го тысячелетия, легионом можно назвать разве что Чёрный Легион(ну и Несущие Слово кое-какую структуру сохраняют), остальные же разбились на варп банды и одеты во что попало.
Насколько я понимаю, так до сих пор и не известно, сколько миров вращается в этом самом Оке Ужаса, но их явно достаточно. Так же к ним можно прибавить прочие миры, находящиеся у меньших по размеру прорывов в Варп. Ну и просто отдалённые от Света Императора миры. В общем полно места для добычи ресурсов и строительства миров-кузниц, адептами тёмных(еретических) механикус. А тут тебе и доспехи и всё что твоей проклятой Императором душе угодно.
Ну и наконец лут, разумеется.